Ao ser introduzido no orgamismo humano, o ozono desencadeia variadas reacções bioquímicas e imunomodeladoras, e é esta cascata de reacções positivas, que vai dar origem à produção de enzimas que vão catalizar mecanismos variados. Ou seja, de forma muito resumida, o ozono provoca uma activação da respiração intracelular a nível mitocondrial, aumentando a concentração de oxigénio no sangue arterial. Assim, são produzidos efeitos imunoestimulantes, desintoxicantes e anti-infecciosos.

O ozono pode ser utilizado eficazmente de forma isolada, ou como adjuvante das terapias convencionais. Consoante a patologia a abordar, a aplicação pode ser local ou sistémica, sendo as vias de administração: intra-articular, intra-muscular, rectal ou endovenosa (auto-hemoterapia).

Devido ao facto de serem desencadeados deversos mecanismos de acção, o aplicabilidade da ozonoterapia é variada, podendo ser utilizada para problemas circulatórios, fistulas, úlceras, hérnias discais, fibromialgia, cansaço crónico, tratamentos estéticos, etc.